63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3870 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3737  hypothetical protein  36.57 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1150  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3528  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  27.98 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  40.3 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0931  solute-binding family 3 protein  24.7 
 
 		 541 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000314501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  27.59 
 
 		 572 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  28.67 
 
 		 572 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  24.38 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  24.38 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  24.24 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  24.75 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  32.63 
 
 		 576 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 665 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1064  EAL domain-containing protein  21.65 
 
 		 541 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0102515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  28.29 
 
 		 597 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  28.37 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  27.45 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  26.15 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  24.06 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1030  histidine kinase  36.23 
 
 		 781 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372079  normal  0.0935457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.87 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  28.97 
 
 		 596 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 584 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  23.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  34.48 
 
 		 578 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  31.62 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 830 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  26.8 
 
 		 596 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.49 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 620 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  33.9 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2774  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  24.24 
 
 		 598 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  33.9 
 
 		 575 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  37.93 
 
 		 608 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  35.59 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 1279 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  24.84 
 
 		 578 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  35.59 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  26.63 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.3 
 
 		 896 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  22.73 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1055 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  25 
 
 		 1048 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.42 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>