26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1150  hypothetical protein  85.66 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3737  hypothetical protein  53.1 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  32.22 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3528  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  26.32 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  28.38 
 
 		 578 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  28.57 
 
 		 578 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  21.67 
 
 		 578 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 665 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 604 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  29.44 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  27.03 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  29.56 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  25.27 
 
 		 608 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  26.94 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 1089 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 609 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  24.51 
 
 		 279 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>