18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1150 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  85.66 
 
 		 244 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3737  hypothetical protein  51.79 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  29.71 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3528  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  27.13 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  27.81 
 
 		 830 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2973  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.73 
 
 		 860 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  24.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 		 1055 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 266 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  25 
 
 		 578 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>