41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2973 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2973  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0180  hypothetical protein  35.47 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0179  hypothetical protein  24.88 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00590711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.29 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  27.19 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.74 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  25.97 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  23.05 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.1 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 955 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.43 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  24.64 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  26.49 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  23.42 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1150  hypothetical protein  38 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 262 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2370  hypothetical protein  25.29 
 
 		 233 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 256 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>