142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4000 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.76 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  26.58 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  26.79 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.27 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.73 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  28.51 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  26.77 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  26.77 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  26.72 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  27.2 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  26.81 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.39 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.09 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  27.85 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  24.24 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.68 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.49 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  27.42 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  27.07 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  24.8 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  28.14 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  27.35 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  23.15 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.33 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  21.79 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  23.87 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.55 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  23.66 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  23.87 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  24.02 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  24.02 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2149  ABC transporter  22.41 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  24.02 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  24.14 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  24.02 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3285  putative amino acid ABC transporter  27.98 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23.46 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  25.96 
 
 		 727 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  23.81 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  25 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  22.63 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4862  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.463107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.73 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  20.09 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  25.76 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  23.01 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.42 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  24.42 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  25.74 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3279  hypothetical protein  25.91 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0523895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  23.18 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 780 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.79 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.03 
 
 		 1410 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  29.35 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.08 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  23.14 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  34.38 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4748  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.65 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.140689  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.77 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  23.11 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.29 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.51 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 710 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  22.58 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0286  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2199  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 		 1279 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0773  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.9 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  24.88 
 
 		 736 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  23.29 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  27.78 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1047 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15200  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  21.23 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 604 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>