114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1574 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  61.54 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  61.54 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  61.54 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  60.73 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  59.92 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  60 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  61.74 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  57.32 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  60 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  49.79 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  52 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  48.95 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2149  ABC transporter  49.4 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  50 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  46.77 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.39 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  34.04 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  33.98 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  32.31 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  25.75 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.79 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  29.02 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  26.38 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.36 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  29.52 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  28.45 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  28.65 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  28.96 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.45 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  29.17 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.59 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.93 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  27.88 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.86 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  30.38 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3432  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.55 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  23.66 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.14 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.27 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.8 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  24.78 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  24.88 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.11 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.57 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  26.69 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  26.69 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  27.14 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1055 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  27.4 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  27.8 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.63 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  23.53 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  24.72 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  27.97 
 
 		 830 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.82 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  26.78 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  26.74 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.91 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  25.99 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  37.68 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  23.11 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  22.93 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  23.44 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>