98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4158 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  97.98 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  31.47 
 
 		 274 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.31 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  26.78 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  25.79 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.36 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  24.78 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  27.36 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.86 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  23.01 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.67 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  25.39 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.55 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.43 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  21.19 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  26.16 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.55 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25.74 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  29.93 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.79 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.93 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.93 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  24.69 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  21.49 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.45 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.37 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25.75 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  23.73 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  22.94 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  23.58 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.32 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 483 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  23.5 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.83 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3279  hypothetical protein  20.18 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0523895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  23.14 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  20.56 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  24.42 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3253  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.92 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0847194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.2 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.83 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  24.62 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  26.98 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  25 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  22.39 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  25.89 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2149  ABC transporter  24.9 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  19.34 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  25.32 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  24.75 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  21.33 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  22.6 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  24.26 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  22.98 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3432  hypothetical protein  34.15 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.52 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  24.26 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  24.26 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  22.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  21.12 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3063  hypothetical protein  23 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00343985  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  24.26 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  22.57 
 
 		 597 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 1075 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  24.17 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  20.75 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 584 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  22.58 
 
 		 255 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>