30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3063 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00343985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  40.5 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1934  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267583  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  26.99 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  24.02 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  23.93 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  24.07 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.56 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  22.97 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  26.24 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 		 615 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  23 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  21.62 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  21.88 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  22.12 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  23.33 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 248 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>