15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1934 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267583  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3063  hypothetical protein  34.03 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00343985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  32.16 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  28.95 
 
 		 405 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  26.52 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 483 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  23.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  24.07 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0286  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.76 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>