276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1707 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 483 aa  969    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 262 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  30.8 
 
 		 262 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 252 aa  100  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.44 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  28.07 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.42 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  25.45 
 
 		 252 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  24.24 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.82 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  23.77 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.53 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.44 
 
 		 755 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.71 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.64 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  23.26 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  23.25 
 
 		 990 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  23.25 
 
 		 990 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.31 
 
 		 243 aa  57  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 252 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3285  putative amino acid ABC transporter  25.3 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 265 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  23.64 
 
 		 255 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2578  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  28.95 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 247 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 260 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  29.47 
 
 		 255 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  34.67 
 
 		 259 aa  54.7  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  24.02 
 
 		 243 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  25.25 
 
 		 262 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  23.56 
 
 		 270 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  22.04 
 
 		 263 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.5 
 
 		 293 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 265 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  24.31 
 
 		 274 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  24.12 
 
 		 247 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 272 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3668  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.46 
 
 		 279 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1934  hypothetical protein  27.71 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267583  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  23.04 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  23.7 
 
 		 247 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0015  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 279 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.28 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  25.37 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  28.18 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  23.85 
 
 		 273 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  27.88 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  29.01 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0358  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.32 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.87 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  25.85 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 		 272 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 		 281 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  24.12 
 
 		 247 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  33.64 
 
 		 257 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 274 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.36 
 
 		 265 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 264 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  21.7 
 
 		 297 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 248 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.48 
 
 		 257 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  22.42 
 
 		 251 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 682 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 275 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  19.31 
 
 		 268 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 		 300 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.31 
 
 		 264 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.79 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>