180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0499 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 457 aa  917    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 262 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.79 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.93 
 
 		 2213 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 265 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.88 
 
 		 264 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.34 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.88 
 
 		 264 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25.88 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.56 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  25.88 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 264 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25.56 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.66 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.34 
 
 		 264 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.34 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  25.44 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.78 
 
 		 1055 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  23 
 
 		 1245 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 258 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 		 1410 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.15 
 
 		 243 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.53 
 
 		 252 aa  57  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  24.11 
 
 		 285 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 258 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 260 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2578  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  26.63 
 
 		 503 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1245 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  19.29 
 
 		 1244 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  24.02 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 262 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  24.84 
 
 		 935 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  23.5 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 251 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  19.53 
 
 		 1065 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  20.91 
 
 		 934 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.53 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  21.8 
 
 		 265 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  20.18 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  22.87 
 
 		 2035 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  21.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  26.42 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 249 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.11 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  22.12 
 
 		 255 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  26.75 
 
 		 244 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.11 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  20.76 
 
 		 273 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  20.67 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 		 290 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  25.45 
 
 		 262 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  18.6 
 
 		 264 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  20.55 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  24.19 
 
 		 243 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  21.46 
 
 		 266 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  31.46 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  23.76 
 
 		 923 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 270 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  25.82 
 
 		 274 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  24.77 
 
 		 264 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  21.23 
 
 		 260 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.58 
 
 		 286 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 279 aa  47  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0229  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 269 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 296 aa  46.6  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.39 
 
 		 912 aa  46.6  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>