118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3185 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  99.27 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  97.81 
 
 		 274 aa  543  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  96.72 
 
 		 274 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  77.48 
 
 		 271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  69.63 
 
 		 272 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  70 
 
 		 272 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  69.63 
 
 		 272 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  69.85 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  53.73 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  60.34 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  50.66 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  51.8 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  46.43 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3338  amino acid ABC transporter  48.95 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  37.05 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  28.46 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  26.27 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.97 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.83 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  26.77 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.67 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.44 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  24.22 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  23.74 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.61 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  23.08 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  23.19 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  23.29 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.51 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.25 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.78 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  24.55 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  24.3 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  24.66 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.59 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.22 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 483 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1277  hypothetical protein  22.55 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  25 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  28.29 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.84 
 
 		 1047 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  21.78 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.5 
 
 		 1047 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  25.58 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  27.21 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  22.77 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  21.92 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.34 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  20.09 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.33 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  22.69 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  21.52 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  21.62 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  22.86 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  21.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  20.09 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  21.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  21.21 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  20.28 
 
 		 457 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  19.4 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2540  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  21.52 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>