90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0526 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.73 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  20.09 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  25 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  26.19 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  25.51 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  23.42 
 
 		 540 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.45 
 
 		 584 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  22.83 
 
 		 576 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  21.19 
 
 		 578 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  19.92 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.3 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  23.28 
 
 		 312 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 620 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  19.31 
 
 		 483 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 		 1047 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  22.27 
 
 		 575 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  19.91 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  19.46 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  22.59 
 
 		 578 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  19.91 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3862  hypothetical protein  21.43 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 770 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  23.42 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 682 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.11 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.22 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  21.57 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  28.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.3 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  21.43 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5122  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123771  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  28.09 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  20.25 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  20.25 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  20.72 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.01 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 767 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.68 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  20.98 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  27.21 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  22.04 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  21.59 
 
 		 830 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  20.78 
 
 		 596 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.37 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  23.76 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2802  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.602775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  19.73 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0974  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  19.73 
 
 		 598 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3063  hypothetical protein  22.86 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00343985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  19.28 
 
 		 596 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 710 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.88 
 
 		 1322 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  23.74 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  25.81 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  24.26 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  22.36 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23.68 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  25.67 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.83 
 
 		 1279 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  25.89 
 
 		 578 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  24.29 
 
 		 712 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  19.82 
 
 		 260 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>