254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3985 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  56.5 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  56.5 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  56.5 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  56.5 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  55.56 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  55.51 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  54.29 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  57.46 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  51.53 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  45.41 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.04 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  28.22 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  31.9 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  26.97 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  25.68 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  26.61 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  29.41 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.41 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  28.34 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.58 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.22 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  25.45 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  22.36 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  27.6 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  21.54 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  26.56 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  27.35 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  25.68 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.46 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  28.32 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  25.77 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  24.38 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.19 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  25.91 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.63 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  27.8 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  26.32 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  29.13 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  25.22 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.87 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  24.56 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  28.73 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  26.54 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  26.23 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  28.1 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  30.59 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.55 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.75 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  30 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  26.15 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 675 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  28.14 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  26.79 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  27.88 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  24.22 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  26.19 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  26.19 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  26.19 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  24.5 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  26.74 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  27.57 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  25.84 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  25.86 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.32 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.22 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 483 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  23.14 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  23.33 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>