95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0574 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  100 
 
 		 243 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  42.17 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  41.15 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  35.48 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.72 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.49 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.21 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  25.64 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  25.5 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  25.11 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  26.51 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  24.6 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  25.65 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  25.3 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  22.96 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  23.17 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  25.23 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  23.79 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  23.36 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  23.77 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  24.19 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  28 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  23.41 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  22.04 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  27.05 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.72 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  22.57 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 483 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  21.37 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  23.67 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.49 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  19.67 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3862  hypothetical protein  20.08 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25.21 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  20.42 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  23.93 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  24.79 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.23 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.79 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  23.47 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.6 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.79 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  22.17 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  21.19 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 457 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.02 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  21.52 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.88 
 
 		 2213 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0252  arginine ABC transporter, substrate-binding protein  24.83 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  34.18 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  21.19 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3338  amino acid ABC transporter  24 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  24.85 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  20.25 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  22.37 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  22.76 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  23.81 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  26.15 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.78 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  23.27 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  23.67 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  23.85 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  20.18 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  19.27 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  24.51 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  21.54 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  21.71 
 
 		 243 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  21.71 
 
 		 243 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 270 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  22.98 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>