40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4312 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  95.51 
 
 
245 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  69.87 
 
 
241 aa  359  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  69.46 
 
 
241 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  66.26 
 
 
241 aa  347  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  68.44 
 
 
244 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  67.86 
 
 
241 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  56.67 
 
 
261 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  53.77 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  49.09 
 
 
243 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  41.67 
 
 
251 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  24.12 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  26.5 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  25.32 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  24.11 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  23.66 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.21 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.89 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  21.24 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.22 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  23.39 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.58 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  23.94 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  21.39 
 
 
253 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.73 
 
 
263 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.11 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  26.15 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.31 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.73 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  22.22 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.73 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  21.08 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
262 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>