51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5012 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  60.43 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  59.24 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  59.15 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  59.15 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  55.33 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  52.34 
 
 		 248 aa  228  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  47.86 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  48.84 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  31.36 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  29.87 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  30.45 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  27.69 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  26.15 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  24.56 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  24.35 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  24.12 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  24.12 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  25.51 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  25.25 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  23.61 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  23.08 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.6 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.57 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.58 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.87 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  23.81 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.81 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  27.04 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  25.62 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.32 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  23.04 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  21.24 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 299 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.28 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  24 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  25.84 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  29.13 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>