44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3869 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  99.59 
 
 		 241 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  92.95 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  84.23 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  69.87 
 
 		 245 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  69.87 
 
 		 246 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  69.46 
 
 		 246 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  69.46 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  75.12 
 
 		 244 aa  341  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  53.39 
 
 		 261 aa  254  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  51.87 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  44.02 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  44.21 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  25.64 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  27.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  25.44 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.98 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  27.54 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  28.1 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.93 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.74 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  23.76 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  22.75 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  24.38 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.74 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  24.08 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  21.19 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.9 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  21.94 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.53 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.81 
 
 		 245 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 253 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>