98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3539 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.19 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  26.72 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  27.9 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  27.67 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  25.11 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  29.61 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  26.07 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  26.97 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  25 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  26.87 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.83 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.71 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  24.23 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3862  hypothetical protein  26.01 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  24.08 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  27.22 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.53 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  26.67 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  27.93 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  30.93 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  30.93 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  22.78 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.35 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3338  amino acid ABC transporter  26.67 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.84 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  26.89 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  27.84 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.56 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.27 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  23.19 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  27.56 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  30.15 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  22.98 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  22.32 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  27.56 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  27.56 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  28.71 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  23.08 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  25.93 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  26.64 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  23.36 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  24.5 
 
 		 736 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.21 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  23.08 
 
 		 727 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  25.79 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2454  extracellular solute-binding protein family 3  22.58 
 
 		 292 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  24.56 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.42 
 
 		 2213 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  26.73 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  26.73 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  21.62 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  21.86 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  26.73 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  20.3 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  23.61 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  20.96 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.97 
 
 		 492 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  22.94 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 		 483 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  23.93 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  27.37 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  28.17 
 
 		 596 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  26.94 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  22.55 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  22.37 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>