25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07039 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  76.4 
 
 		 251 aa  410  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2080  amino acid ABC transporter  33.75 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2549  amino acid ABC transporter  34.16 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2232  hypothetical protein  32.08 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  25.51 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.25 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  22.13 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  22.13 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  22.13 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  22.12 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  24.89 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.98 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  21.74 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.88 
 
 		 490 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  22.18 
 
 		 714 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  21.3 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  23.53 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.2 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  23.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  23.81 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  22.18 
 
 		 266 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  21.26 
 
 		 247 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>