25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3647 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  78.57 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  46.52 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  45.33 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  46.5 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  47.73 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  47.73 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  23.73 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  24.57 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  24.51 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  24.03 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.36 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0372  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  25.5 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.69 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.34 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  22.18 
 
 		 251 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>