27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3802 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  84.17 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  52.04 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  53.1 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  52.47 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  48.7 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  48.7 
 
 		 268 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  45.45 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  44.93 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  28.76 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  28 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.2 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  23.11 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  27.59 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2080  amino acid ABC transporter  22.89 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.53 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.78 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  21.77 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0372  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  23.23 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  26.63 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  24.44 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  23.53 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>