51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0805 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  62.6 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  62.6 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  63.11 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  62.6 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  66.06 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  66.97 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  66.51 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  54.43 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  58.33 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  54.29 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  26.75 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  22.51 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.07 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.61 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.21 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  23.3 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  26.06 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  23.55 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  25.94 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  25.55 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.92 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  25.25 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.83 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  23.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  23.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  23.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.99 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  23.72 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.72 
 
 		 278 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 1109 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  20.6 
 
 		 268 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 288 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 251 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>