34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1804 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  54.2 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  53.78 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  53.88 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  48.26 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  53.1 
 
 		 259 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  52.7 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  48.12 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  27.06 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  27.98 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  26.29 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  25.32 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  25.51 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.99 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  23.08 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0372  hypothetical protein  24.19 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  22.36 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  22.36 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  22.36 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  22.36 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  23.32 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.84 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  28.67 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.12 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.16 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  22.28 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2385  hypothetical protein  27.1 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>