20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0372 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  35.66 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.6 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  28.06 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3310  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  22.32 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.4 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.19 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  24.84 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  24.19 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0117  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  22.42 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  24.22 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.22 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>