111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0301 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.68 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.1 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  27.09 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  27.04 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  25.22 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  24.66 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  24.66 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  24.66 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.44 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.91 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  25.11 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.07 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.56 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  24.66 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  24.66 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  26.58 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0854  extracellular solute-binding protein family 3  22.33 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0178983  normal  0.218059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  25.1 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  25.68 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  29.03 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  25.11 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  21.65 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.41 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  27.61 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  30.36 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  27.61 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  21.03 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  21.36 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.56 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  23.86 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  23.31 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  23.31 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  24.14 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  20.53 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 1055 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  20.38 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.76 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.02 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 		 1165 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  24.19 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  22.32 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  23.3 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  25.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  21.67 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  21.03 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  26.75 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  24.78 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  24.03 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.56 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  27.22 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.21 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  24.21 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  25.71 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.21 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.21 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.21 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.21 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  23.04 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  21.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  23.39 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  23.39 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  23.39 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  18.38 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  24.58 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.98 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  19.91 
 
 		 490 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  24.06 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  24.22 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  24.06 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>