More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0823 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.69 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  35 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  37.04 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.44 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  33.49 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.03 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  33.77 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  26.27 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  34.05 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  27.24 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  30.57 
 
 		 297 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  25.59 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  25.42 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.59 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.59 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  29.86 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  25.38 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  23.18 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  23.01 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  24.5 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  22.75 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  26.6 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.22 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  23.98 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  23.58 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  24.78 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.65 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  26.36 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  27.03 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  26.69 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.57 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  22.71 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  22.71 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  22.81 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.86 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  26.48 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.58 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  30.11 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  23.74 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.94 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  24.56 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  25.87 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.7 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  26.43 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  27.04 
 
 		 830 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.64 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  23.48 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  24.6 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  23.11 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  24.6 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  24.6 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  25.42 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 1055 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  27.62 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  27.45 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.57 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  26.36 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>