43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1179 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 385 aa  752    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  35.38 
 
 		 245 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  28.47 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  22.86 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 265 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  23.74 
 
 		 266 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  31.97 
 
 		 288 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 252 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 262 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 295 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.55 
 
 		 262 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.78 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  23.69 
 
 		 250 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  23.29 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  28.8 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  21.7 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0340  peptidoglycan-binding LysM  25.54 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  25.26 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.92 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  23.47 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  27.53 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  28 
 
 		 251 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  19.32 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  35.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.39 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  28.45 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  31.01 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  25.87 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 252 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  23.11 
 
 		 268 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  28.8 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.83 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  28.1 
 
 		 247 aa  42.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>