65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3247 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  99.2 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  99.2 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  98.4 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  74 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  73.6 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  73.2 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  63.11 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  52.05 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  54.62 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  52.94 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.49 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  25.22 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.62 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  22.13 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  21.69 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.38 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  22.73 
 
 		 578 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.87 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.72 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.41 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  22.36 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  21.4 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  23.36 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  22.05 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  23.02 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  25 
 
 		 727 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  23.28 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  24.07 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  23.02 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  20.87 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  22.62 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.26 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  22.83 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  23.02 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0854  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0178983  normal  0.218059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  23.25 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  20 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  22.32 
 
 		 560 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  19.75 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.71 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  24.31 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  19.75 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  25.15 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 245 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>