161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1423 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  39.83 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  36.57 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  32.37 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  33.89 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  31.91 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  31.91 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  31.3 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  33.76 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  31.91 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  31.91 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  35.19 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.38 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  32.91 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  33.79 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  31.33 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  35.24 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.69 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.69 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  34.91 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  32.54 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  26.97 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  26.29 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2149  ABC transporter  29.66 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  32.17 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  29.86 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.78 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  27.19 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.62 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  27 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.44 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  26.45 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  26.45 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  26.45 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  26.2 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  26.27 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.2 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.71 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  30.73 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  26.27 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.29 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  23.67 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  30.34 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  26.23 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.48 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  25.39 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.48 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  25.91 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  28.5 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  27.57 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.72 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.4 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.57 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  24.22 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  27.11 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  26.99 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3432  hypothetical protein  23.14 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  21.9 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0341  hypothetical protein  27.53 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.62 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1055 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>