28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3602 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2385  hypothetical protein  36.59 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  31.1 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  28.38 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  30.06 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  26.37 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  32.31 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  28.29 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.12 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  27.33 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  25.24 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  25.5 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  37.93 
 
 		 385 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  23 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1055 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  25.55 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>