14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2080 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2080  amino acid ABC transporter  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2549  amino acid ABC transporter  48.95 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  35.17 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  33.75 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2232  hypothetical protein  35.22 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  22.89 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2385  hypothetical protein  22.77 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.53 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.05 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  23.62 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  23.39 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  24.71 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>