More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1619 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  60.46 
 
 
270 aa  328  9e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  44.32 
 
 
282 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.01 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.29 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  38.27 
 
 
277 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.22 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.14 
 
 
502 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.14 
 
 
502 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.13 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  32.5 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
252 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
259 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
259 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.84 
 
 
248 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.4 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  29.07 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  29.07 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.48 
 
 
503 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  31.13 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  27.75 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.04 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.04 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1610  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.69 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0616961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.44 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.44 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  27.57 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.44 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.82 
 
 
503 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  26.56 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.52 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.59 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.24 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.24 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.75 
 
 
489 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.6 
 
 
266 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  26.75 
 
 
489 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.04 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.89 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.31 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  25.83 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.34 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.31 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.31 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.94 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.94 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  28.02 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.9 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0671  extracellular solute-binding protein family 3  28.47 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.75 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  26.49 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  28.63 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.44 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.92 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.66 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 
259 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.69 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.03 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.97 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.93 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  28.25 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  24.73 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  29.59 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.03 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
252 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  25.72 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.65 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>