More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0339 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  96.45 
 
 
282 aa  552  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  65.6 
 
 
277 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.01 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  36.67 
 
 
270 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.49 
 
 
282 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.45 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.21 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
259 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
259 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
268 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  32.17 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.43 
 
 
262 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  32.97 
 
 
502 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  32.97 
 
 
502 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
265 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.94 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 
503 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.31 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
273 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.57 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.57 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.57 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.57 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.62 
 
 
503 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  31.2 
 
 
263 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.21 
 
 
265 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.21 
 
 
265 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.42 
 
 
489 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.21 
 
 
265 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.42 
 
 
489 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  30.42 
 
 
489 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  29.32 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  29.26 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.26 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.26 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  29.26 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
264 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.89 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.89 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.71 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  30.31 
 
 
257 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  29.63 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.68 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.89 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  28.21 
 
 
286 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  29.54 
 
 
257 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  30.04 
 
 
260 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  28.87 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
257 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.52 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.52 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0384  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.79 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.51 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.51 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.15 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.15 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.04 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.36 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.41 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.15 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  26.02 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.67 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.67 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.67 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.67 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.57 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.03 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  30.33 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.03 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.67 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.03 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.03 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>