More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2344 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.21 
 
 
282 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.51 
 
 
282 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.51 
 
 
282 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  30.74 
 
 
277 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  33.58 
 
 
270 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.22 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.95 
 
 
273 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  28.57 
 
 
286 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  32.95 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.64 
 
 
502 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.64 
 
 
502 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0671  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  28.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.36 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.47 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.47 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  28.51 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  27.62 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  28.94 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.76 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.76 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.76 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.25 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  26.85 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.66 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.66 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.94 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.81 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.81 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.81 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.81 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.76 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  24.09 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.81 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4191  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.24 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.28 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.45 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.28 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  23.19 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.27 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  25.1 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.81 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  26.2 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.97 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  26.55 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  24.68 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.63 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  25.54 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  26.75 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.54 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.54 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  25.19 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.54 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.02 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.02 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.02 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.02 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  26.64 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.09 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  24.79 
 
 
572 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.66 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.66 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.66 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
246 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
272 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.3 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  27.2 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  25.18 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.62 
 
 
503 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.3 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  22.43 
 
 
489 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  22.43 
 
 
489 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  26.23 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>