280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0671 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0671  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  32.14 
 
 
286 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  27.55 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.34 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.57 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.47 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  24.9 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.15 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.15 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  25.56 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  29.63 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.47 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  27 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.32 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  31.02 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  28.33 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.43 
 
 
502 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.43 
 
 
502 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.77 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  30.56 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.47 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0369  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  24.47 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.33 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  27.31 
 
 
572 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.33 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.82 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0974  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.02 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.27 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.77 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.96 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.77 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5122  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123771  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.58 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
780 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.29 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.42 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2802  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.602775  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.62 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.57 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.18 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.19 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  27.16 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.57 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.1 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  22.05 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.1 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  25.95 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  24 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.47 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.19 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5809  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.287013  normal  0.321236 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  25.67 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>