More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0333 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  96.45 
 
 
282 aa  552  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  63.12 
 
 
277 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.29 
 
 
276 aa  198  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  36.3 
 
 
270 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.8 
 
 
282 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.45 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 
259 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 
259 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.24 
 
 
273 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.08 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  31.74 
 
 
271 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
265 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 
268 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.86 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.86 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.86 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.86 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.87 
 
 
502 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.87 
 
 
502 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.18 
 
 
265 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.5 
 
 
265 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.5 
 
 
265 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.5 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
281 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 
489 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.82 
 
 
503 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 
489 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
503 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  29.28 
 
 
489 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  30 
 
 
263 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  28.57 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.52 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.52 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.52 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.52 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
278 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.15 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  28.84 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.92 
 
 
260 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  26.07 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  29.54 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.03 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.15 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.95 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.51 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.51 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  28.36 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  29.49 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  26.41 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.79 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.78 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.78 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.36 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  28.51 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.36 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.41 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.41 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4191  extracellular solute-binding protein family 3  28.73 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.64 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  29.82 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  28.28 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  29.91 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.03 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>