46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1052 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  93.15 
 
 		 248 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  49.14 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  49.16 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  47.68 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  46.15 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  47.26 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  45.93 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  54.21 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  31.75 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  31.75 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  28.39 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  28.23 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  26.5 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  26.92 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  26.5 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  28.15 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  26.92 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  27.98 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  28.15 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  27.12 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  23.5 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  28.75 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  22.53 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  22.76 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  19.27 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  21.48 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  19.83 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.01 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  20.76 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  22 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.34 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  26.64 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.36 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  21.61 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.32 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 268 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.26 
 
 		 253 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 258 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>