More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0556 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  93.78 
 
 		 243 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  56.02 
 
 		 245 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  54.73 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.36 
 
 		 245 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  56.71 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  58.18 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  53.11 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.17 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  37.78 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  31.25 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  32.54 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  30.45 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  30.45 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  30.45 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  29.87 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  30.96 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  32.13 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  31.67 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.62 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  29.2 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  27.8 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  28.74 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  28.18 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.38 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  28.74 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 286 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  28.03 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  27.62 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  27.62 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.82 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  30.77 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  24.71 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.68 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  25.87 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.47 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  31.31 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  32.57 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  29.82 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  29.82 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  29.82 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  28.71 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  30.89 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  29.36 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  28.79 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  24.51 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  24.21 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  24.81 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  29.38 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  28.04 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  27.03 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  32.19 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  28.44 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.09 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0341  hypothetical protein  27.13 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  24.03 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.93 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.32 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.77 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.77 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.74 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.77 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  24.57 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.17 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>