128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1185 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.8 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  32.23 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  28.47 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  26.48 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  28.17 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  29.27 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.3 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  25.3 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  23.47 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.06 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.09 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.16 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  25.51 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  23.58 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  23.58 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  26.92 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  22.06 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  22.96 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  24.34 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  23.32 
 
 		 572 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  22.96 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  24.19 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  23.32 
 
 		 572 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  23.98 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  27.6 
 
 		 830 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1055 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  20.18 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  22.62 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  23.92 
 
 		 483 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.9 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.99 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  48.44 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  32.48 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  26.6 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  22.48 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  19.75 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1080 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  24.14 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  24.68 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.75 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  23.08 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 843 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  19.92 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  23.18 
 
 		 937 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  27.57 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.18 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  29.12 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  25.49 
 
 		 937 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  35.62 
 
 		 599 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.58 
 
 		 333 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  35.62 
 
 		 597 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  20.33 
 
 		 487 aa  45.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 937 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  22.02 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  20.97 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  23.04 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  22.93 
 
 		 937 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  27.82 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  29.41 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  25 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  23.83 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>