77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2873 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  39.59 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  43.62 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  40.15 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  29.13 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.5 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  29.13 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.85 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  26.72 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.3 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.68 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  24.71 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  25.66 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  26.05 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.66 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  26.05 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  26.61 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 710 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 492 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  48.44 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  27.68 
 
 		 468 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  26.13 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  24.03 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  26.45 
 
 		 480 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.18 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1080 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.29 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  24.62 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  24.62 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.27 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1594  arginine-binding protein  23.76 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.89 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  25.74 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 615 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 648 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.52 
 
 		 860 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  22.1 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  20.62 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  26.83 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  26.15 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  20.73 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  23.74 
 
 		 937 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  36.76 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.47 
 
 		 896 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.44 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  22.36 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.59 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4217  ABC type amino acid transport system periplasmic component protein  23.85 
 
 		 265 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>