More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0325 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 283 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4645  hypothetical protein  25.45 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.1 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.31 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  32.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.88 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  22.51 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2540  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.41 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 2654 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  21.96 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  29.05 
 
 		 896 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.62 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.92 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  22.89 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.87 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  29.13 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  24.44 
 
 		 830 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 1055 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.28 
 
 		 502 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.28 
 
 		 502 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 843 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  24.69 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  25.58 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  23.04 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.12 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1094  hypothetical protein  30.67 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.396494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  27.94 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  22.35 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  27.23 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  25.85 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  21.76 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  21.76 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  21.76 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 1047 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0036  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.62 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.92 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0037  hypothetical protein  30.07 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  27.32 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  27.23 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.12 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.38 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  25.85 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>