63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1802 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  61.99 
 
 		 283 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 2654 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  42.47 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  24.51 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  24.02 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  22.39 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  22.35 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.41 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  22.73 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  22.35 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2540  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  27.88 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  30.13 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  26.01 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  30.77 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1094  hypothetical protein  29.33 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.396494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0514  hypothetical protein  24.45 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  25.99 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  26.4 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  26.4 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24 
 
 		 860 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  30.69 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4075  hypothetical protein  25.84 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  25.91 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 1165 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  28.06 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  30.69 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  24.24 
 
 		 565 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.95 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0540  hypothetical protein  24.2 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  26.06 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  24.19 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.81 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3803  hypothetical protein  24.66 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0535  hypothetical protein  24.55 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  22.47 
 
 		 513 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  28.15 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  21.9 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  29.1 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  25.51 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  29.1 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 262 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  29.1 
 
 		 251 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  22.99 
 
 		 245 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>