23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4075 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4075  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  84.9 
 
 		 281 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  84.49 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  83.67 
 
 		 281 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0514  hypothetical protein  71.84 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0535  hypothetical protein  71.02 
 
 		 282 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  71.84 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0540  hypothetical protein  71.84 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3803  hypothetical protein  71.02 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0483  hypothetical protein  48.72 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2684  hypothetical protein  50.61 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3289  hypothetical protein  33.47 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  31 
 
 		 597 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  31 
 
 		 599 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  28.8 
 
 		 596 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.74 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  27.83 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.63 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 584 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>