49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0540 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0514  hypothetical protein  98.94 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3803  hypothetical protein  98.23 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0535  hypothetical protein  97.87 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  70.92 
 
 		 282 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  70.92 
 
 		 281 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  71.63 
 
 		 281 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  70.57 
 
 		 281 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4075  hypothetical protein  71.84 
 
 		 245 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0483  hypothetical protein  53.14 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2684  hypothetical protein  47.24 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3289  hypothetical protein  32.25 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.47 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.51 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.05 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  25.15 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  22.93 
 
 		 608 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.86 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  28.57 
 
 		 597 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  28.57 
 
 		 599 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  26.17 
 
 		 572 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.78 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  27.55 
 
 		 572 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  21.94 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.82 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  26.53 
 
 		 596 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 584 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.5 
 
 		 1055 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  25.36 
 
 		 578 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.44 
 
 		 609 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>