More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4481 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  57.96 
 
 
255 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.92 
 
 
253 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 
245 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  56.33 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  56.33 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.48 
 
 
284 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  36.64 
 
 
284 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.89 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.74 
 
 
282 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.03 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  30.29 
 
 
296 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
282 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.71 
 
 
291 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.43 
 
 
282 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.61 
 
 
299 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  31.33 
 
 
272 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30 
 
 
282 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.39 
 
 
287 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.57 
 
 
283 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.43 
 
 
297 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
297 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
281 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.43 
 
 
280 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.93 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
334 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.81 
 
 
306 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  25.85 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  25.4 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.77 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  28.76 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  26.75 
 
 
586 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  25.41 
 
 
320 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0401  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  25.33 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  26.82 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  25.84 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5603  extracellular solute-binding protein family 3  30.52 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25.69 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  23.65 
 
 
294 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  27.27 
 
 
583 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  24.69 
 
 
317 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0076  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  29.33 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.98 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.51 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  25.95 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  25.27 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.66 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  25.27 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.86 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  26.48 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  23.76 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.47 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  23.86 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3742  ABC amino acid transporter, periplasmic binding protein  24.78 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3473  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.71315  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>