More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  100 
 
 
327 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  60.29 
 
 
354 aa  321  9.000000000000001e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  54.68 
 
 
298 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  44.91 
 
 
264 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  39.87 
 
 
296 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  38.31 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  37.72 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  38.31 
 
 
282 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.8 
 
 
284 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  37.3 
 
 
284 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 
281 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  32.89 
 
 
284 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
297 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  34.94 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.11 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  35.21 
 
 
304 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  35.74 
 
 
299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.66 
 
 
283 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  31.15 
 
 
272 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
290 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.19 
 
 
287 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.97 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.96 
 
 
282 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.34 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
282 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
334 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
259 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
259 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  28.18 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.85 
 
 
243 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
255 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  30.19 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  27.2 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.49 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.1 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.13 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.38 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.13 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.13 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.68 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.68 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.33 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.47 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.68 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.72 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.06 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  25.09 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  24.26 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.23 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  31.15 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  24.26 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  28.32 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.31 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  29.44 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.38 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.38 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  26.87 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  27.86 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.07 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  24.66 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
248 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
272 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  28.82 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>