More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0635 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  42.39 
 
 
299 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  37.66 
 
 
282 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  35.27 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 
334 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  34.62 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.04 
 
 
284 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.33 
 
 
291 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  33.47 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.28 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
281 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
297 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.51 
 
 
280 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.54 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.43 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.34 
 
 
243 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  31.67 
 
 
327 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  28.63 
 
 
272 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
290 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25.38 
 
 
282 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25.65 
 
 
282 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  28.03 
 
 
283 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
255 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  29.96 
 
 
298 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.87 
 
 
253 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.64 
 
 
297 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25.73 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  23.64 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1712  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.94 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  27.57 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2859  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.9 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.582103  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 
755 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  32.56 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
604 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.64 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2496  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.75 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.75 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2542  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.75 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2596  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.75 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.86 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  33.05 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3432  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5166  extracellular solute-binding protein family 3  40.23 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.19 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.19 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.19 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.63 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.25 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  24.03 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.2 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  28 
 
 
596 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  27.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2688  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25.83 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3450  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25.83 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2658  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.9 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  29.15 
 
 
990 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  29.15 
 
 
990 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1330  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.11 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.27 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
250 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.82 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  30.47 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>