More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4600 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.55 
 
 
306 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  35.6 
 
 
296 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  38.29 
 
 
298 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  37.05 
 
 
295 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  32.89 
 
 
284 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  35.21 
 
 
327 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  34.18 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  34.83 
 
 
264 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 
354 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  29.76 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
284 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.73 
 
 
282 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.42 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
290 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
281 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.36 
 
 
283 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.93 
 
 
282 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.93 
 
 
282 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.51 
 
 
280 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  29.24 
 
 
272 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.76 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  29.63 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.8 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  28.52 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  27.91 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  27.8 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  27.63 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  27.63 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  31.93 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  27.63 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  27.63 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  27.63 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  27.63 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  26 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  27.66 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  27.35 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  27.13 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.5 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  24.28 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  27.61 
 
 
258 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  28.12 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  35.79 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  30.6 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  26.26 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  26.74 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  26.98 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  26.74 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  26.74 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  26.74 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
249 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  26.97 
 
 
248 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  26.44 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  29.85 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.32 
 
 
266 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
290 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.94 
 
 
265 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  26.19 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.65 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.88 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.55 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.55 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  30.07 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  28.85 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.32 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.88 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.65 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.24 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.83 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>