More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0746 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  43.24 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.88 
 
 
284 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  44.67 
 
 
282 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  44.26 
 
 
282 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  41.57 
 
 
284 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  43.5 
 
 
283 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  40.66 
 
 
284 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  43.32 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  40 
 
 
296 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 
281 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  40.98 
 
 
299 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  38.74 
 
 
291 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  39.76 
 
 
287 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 
281 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  38.77 
 
 
327 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  35.88 
 
 
306 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  40.91 
 
 
264 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 
297 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  35.25 
 
 
298 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 
304 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  31.87 
 
 
354 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  32.75 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.89 
 
 
243 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.51 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
255 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
255 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 
255 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
260 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.48 
 
 
281 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.4 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.35 
 
 
243 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  28.18 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.11 
 
 
503 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.64 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.74 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  32.43 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.63 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.39 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.73 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.31 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  29.31 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.97 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  28.97 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.97 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.97 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.05 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.12 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.27 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.01 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.6 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.63 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  27.8 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.92 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.32 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>